近年來，隨著外界對于環(huán)境污染問題的日益重視，生態(tài)修復也隨之成為學術界的熱點。太湖、青島等地用生態(tài)修復的辦法應對藍藻暴發(fā)也取得一定成效。但中科院南京地理與湖泊所研究員胡維平表示，水污染治理，人們不能*寄希望于生態(tài)修復。專家表示，建設一個與湖泊水環(huán)境保護目標相匹配，社會、經濟、環(huán)境和諧發(fā)展的綠色流域，是湖泊環(huán)境保護與水污染防治的關鍵之所在。
在進行污染湖泊的修復工作時，可以利用一些沉水植物從湖泊水體及沉積物中吸收富含的營養(yǎng)物或化學物質，再利用沉水植物作為魚類的食物、為其他生物提供棲息的場所的功能，對湖泊生物鏈網(wǎng)進行優(yōu)化改造，zui終達到改善環(huán)境和水質的目標。但問題是，一些江河湖泊為防洪防侵蝕，建立了大量的硬質堤壩，切斷了陸域生態(tài)系統(tǒng)到水域生態(tài)系統(tǒng)的連續(xù)性，江河湖生態(tài)環(huán)境緩沖帶消失，加重了藍藻水華、供水危機、生產安全等環(huán)境問題。
湖泊（水庫）生態(tài)系統(tǒng)的封閉性大，自我恢復的能力弱。目前對受損湖泊（水庫）生態(tài)系統(tǒng)修復的方法和技術主要有以下五點：一是嚴禁圍湖造田，科學劃定水源保護區(qū)范圍。二是營造林地，加大湖泊（水庫）區(qū)周邊退耕還林力度，提高湖泊周圍整個流域的植被覆蓋率，減少面源污染的危害，增強涵養(yǎng)水分的能力；鞏固退耕還林成果，解決退耕農戶長遠生計問題。三是加大人為調控湖泊水位的力度，盡量防止水位頻繁的劇烈變化，確保湖泊（水庫）的水量。四是對入湖泊（水庫）的河道逐條進行治理，減少污水排入湖（庫）。五是強化湖泊（水庫）的流域管理，依法治理，協(xié)調社會、經濟、環(huán)境效益。
由此可見，建設一個與湖泊水環(huán)境保護目標相匹配，社會、經濟、環(huán)境和諧發(fā)展的綠色流域，是湖泊環(huán)境保護與水污染防治的關鍵之所在。要堅持“讓湖泊休養(yǎng)生息”為指導思想，以“建設綠色流域”為基礎和核心，采取“污染源系統(tǒng)控制、清水產流機制修復、湖泊水體生境改善、系統(tǒng)管理與生態(tài)文明建設”的治湖新思路，構建流域管理與生態(tài)文明構建體系等六大體系。